El área de Oceanografía Operacional del Centro de Investigaciones Oceanográficas e Hidrográficas de Caribe, se encarga de impulsar el desarrollo tecnológico y generación de conocimiento sobre oceanografía y meteorología marina orientadas al conocimiento de las características del territorio marino costero colombiano, como elemento estratégico de soberanía y en función del apoyo a las necesidades operacionales de la Autoridad Marítima Nacional, DIMAR, y como elemento fundamental en el desarrollo integral de la comunidad marítima nacional. Los proyectos desarrollados por el grupo de Oceanografía Operacional se encuentran encaminados a generar conocimiento oceanográfico, productos de investigación oceanográfica y herramientas numéricas para la predicción de las condiciones que permitan garantizar la seguridad marítima integral del país y apoyar el desarrollo del sector marítimo colombiano, así como impulsar a Colombia a posicionarse como potencia marítima regional, en el mediano plazo.